Ingénieur de recherche H/F

L'unité UMRS1310 est rattachée à la commission CSS2 Cancer de l’Inserm, et fait suite à l’unité U935 créée en 2009, renouvelée à la vague E en une mono-équipe dirigée par le Pr A. Turhan qui étudie les mécanismes de résistances des cellules souches cancéreuses et stratégies innovantes thérapeutiques dans les cancers et leucémies. L'U1310 a bâti au cours des précédentes années une expertise internationale dans le domaine des cellules souches embryonnaires (CSE) et pluripotentes induites (iPSC). L’équipe développe des modèles physiopathologiques d’hémopathies malignes et cancers héréditaires. L’unité est pionnière dans la génération d’organoïdes 3D de cancers à partir de l’ingéniérie des cellules iPSC issues de patients porteurs de mutations oncogéniques. Ces modèles innovants miment les cellules souches tumorales et reproduisent l’hétérogénéité génétique des cancers.

Ces outils ont pour double objectif :

1/ la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques par une approche génomique et bio-informatique. Nous avons ainsi identifié des biomarqueurs pronostiques et théranostiques pour des thérapies ciblées et immunothérapies actives, par des approches innovantes vaccinales, dans les leucémies aiguës, les cancers du poumon non à petites cellules et les cancers du sein.

2/ la conception de stratégies d’immunothérapies cellulaires et géniques, utilisant les cellules de l’immunité innée et adaptative dérivées des iPSC, qui expriment des nouveaux CAR (Récepteurs Antigéniques Chimériques) identifiés dans l’unité.

Ces projets scientifiques sont conjointement réalisés avec l’UMS45 CITHERA, créée et labélisée en 2020 par le dispositif PIA-4 France 2030 dirigée par le Pr Annelise Bennaceur-Griscelli, qui coordonne l’infrastructure INGESTEM ( www.ingestem.org)              « Cellules souches pluripotentes induites et ingénierie tissulaire ». La plateforme a mis au point les technologies les plus récentes d’ingénierie du génome pour transformer de manière stable et efficace les iPSC et dérivés cellulaires par les systèmes CRISPR / CAS9 en vue de produire de façon standardisée les cellules de l’immunité T NK CD et Macrophages pour les programmes de thérapies cellulaires dans les cancers.
Nos activités translationnelles sur ces programmes communs lient naturellement l’U1310 à l’UMS CITHERA dans le cadre du grand défi ‘Biothérapie – Bioproduction’ France 2030, allant de la recherche pré-clinique expérimentale à la bioproduction pour des futures phases cliniques précoces.

Missions de l’agent·e :

1.Responsable de l’Ingénierie Cellulaire et génomique des cellules souches pluripotentes

• Assurer les nouvelles technologies d’édition du génome par différentes approches (Crispr Cas9,
  nouveaux vecteurs , ARNm) ;
• Travailler en équipe pour différents projets de l’u1310 et la communauté scientifique ;
• Amplification de lignées/clones iPSC qualifiés de grade recherche à partir de cellules somatiques humaines normales et pathologiques (patients) et animales ;
• Transformation génétique des cellules iPSC ou progéniteurs /organoïdes d’intérêt pour :
  - corriger une mutation et générer une lignée iPSC et dérivés cellulaires isogéniques comme tissu témoin 
  - introduire une mutation ponctuelle et modéliser un variant moléculaire d’une pathologie
  - intégrer des systèmes rapporteurs dans le génome d’une lignée d’iPSC ou dérivé cellulaire pour suivre un processus         cellulaire ou moléculaire ou cribler des chimiothèques sur un phénotype d’intérêt
  - modifier l’expression d’un gène (activation ou répression)
• Introduire de nouvelles séquences fonctionnelles (ex : récepteurs synthétiques, CAR) dans les IPSC en vue de la production de cellules NK, Lymphocytes T, cellules dendritiques, et macrophages ;
• Caractérisation moléculaire des clones iPSC selon les tests standards internationaux et tests sécuritaires (Introduction de gènes suicides, analyses des Off-targets).

2.Réaliser la veille scientifique et technologie des outils d’ingéniérie cellulaire et génomique

3.Formation des étudiants

Accompagner les étudiants dans leur projet au sein de l’équipe

4.Réaliser les tâches collectives pour le bon fonctionnement du laboratoire

• Gestion de la banque commune des IPSC grade recherche ;
• Prendre la responsabilité de certains équipements du laboratoire avec le suivi des maintenances ;
• Participer à la gestion des échantillons de la banque des IPSC en lien avec les outils développés par CITHERA dans un soucis de traçabilité des ressources biologiques.

5.Participer à la vie scientifique du laboratoire

• Bibliographie, cours, présentation des travaux, communications ;
• Rédiger les protocoles et être garant de leur évolution ;
• Rédiger les rapports scientifiques et technologiques pour les articles et demandes de financement.